बाबा सिद्दीकी मर्डर केस की जांच एनकाउंटर स्पेशलिस्ट दया नायक कर रहे हैं। वहीं आरोपियों पर भारत न्याय संहिता की धारा 103(1), 109, 125 और 3(5) तहत मामला दर्ज किया गया है।